Международная группа исследователей выявила в Калуге самый длительный случай заражения коронавирусом, что привело к появлению высокомутированного и крайне необычного варианта вируса.
Результаты исследования опубликованы в журнале Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. У пациентки с ВИЧ из Калуги вирус эволюционировал примерно в течении двух лет. Проблема заключалась в том, что она не принимала антиретровирусную терапию.
Образец, который у нее взяли в октябре 2022 года, принадлежал к почти вымершей к тому времени линии B.1.1. С 2020 года он успел накопить 89 уникальных мутаций по сравнению со своим ближайшим известным «предком».
Скорость накопления мутаций у пациентки была в 3,7 раза выше, чем у вируса, циркулировавшего в общей популяции, и сопоставима со скоростью, с которой образовался вариант Omicron. Эволюция шла под сильным положительным отбором, что указывает на адаптацию к давлению иммунной системы.
Некоторые мутации в образце крайне редки в базах данных последовательностей из респираторных проб, но часто встречаются в вирусах, обнаруживаемых в сточных водах. Это позволяет предположить, что часть своего эволюционного пути вирус провел в желудочно-кишечном тракте пациентки, которая изначально поступила в больницу с желудочно-кишечными симптомами.
Ученые предполагают, что новые мутации коронавируса могут зарождаться в организме людей с хронической инфекцией, например, с иммуносупрессией. Длительное нахождение вируса в организме дает ему уникальную возможность накопить комбинации мутаций, повышающих заразность или позволяющих уклоняться от иммунитета.
Кроме того, исследование показало, что ЖКТ может быть «резервуаром» для длительной инфекции, что подчеркивает важность мониторинга сточных вод для отслеживания необычных эволюционных трендов вируса.
В научной работе подчеркивается, что штамм, выявленный у пациентки, не привел к новой вспышке коронавируса и не был обнаружен больше ни у одного человека. Это может говорить о том, что не все такие «супер-мутировавшие» вирусы обязательно становятся успешными в общей популяции. Тем не менее, исследование показывает, что SARS-CoV-2 еще не исчерпал свой эволюционный потенциал.
Как сообщал «ГлагоL», за прошлую неделю заболеваемость коронавирусом в России выросла на 13,8% — заразились 8,2 тыс. человек.